對于ISO三體系認證的付款方式，一般而言，認證機構會在認證前要求企業支付費用，并在證書發布后進行查詢。

在具體的認證過程中，不同的認證機構和地區可能會有不同的操作方式，所以企業在選擇認證機構和實施認證前應該詳細了解認證流程和相關規定，以免出現誤解或不必要的麻煩。

同時，企業也應該根據自身情況和預算合理選擇認證機構，確保認證的準確性和合法性。